اتهم الدكتور عبد الفتاح البنا،أستاذ المواقع الأثرية بكلية الآثار جامعة القاهرة، الدكتور يوسف خليفة،رئيس قطاع الآثار المصرية سابقًا،مسئولية اختفاء القطع الأثرية أثناء الـ 15 سنة الماضية مدة توليه مسئولية قطاع الآثار المصرية،حيث صرحت وزارة الآثار المصرية اختفاء 32.600 الف قطعة أثرية أثناء هذه الفترة.

فيما أعترض الدكتور يوسف خليفة،خلال لقائه مع الإعلامى ماجد على فى برنامجه لقمة عيش والذى يذاع على قناة "LTC"،علي هجوم البنا وليس له صفة في توجيه الاتهامات،موضحًا أن التلاعب بالإحراز الخاصة بوزارة الآثار ليس له الحق في الاقتراب منها ومسئولية 8 أشخاص،بالإضافة إلي المفقودات الأثرية الـ 32.00 ألف فقدت علي مدار 25 عام مضت من المتاحف والمخازن المصرية،مؤكدًا أن المخطئين تم تحويلهم إلي النيابة العامة.

ونفي خليفة،مسئوليته عن الآثار المفقودة،حيث أنه عين رئيس قطاع الآثار المصرية عام 2014 ثم رئيس الإدارة المركزية بوزارة الآثار المصرية حتى وصولي لسن التقاعد عام 2016،مؤكدًا أن كل من أخطي في مدة تقلده منصب رئيس القطاع اتخذت القرارات القانونية ضده،كما أنه تم تكليفي من قبل النيابة العامة برئاسة لجنة لجرد مخزن "الأشمونين" وهذا شرف لي،وأعدت تقرير يؤكد اختفاء 1000 قطعة من المخزن والقضية مازلت في النيابة الإدارية ولم تتحرك حتى الآن.