ستنطلق منافسات المرحلة الثالثة بمباراة الجولة الأولى يوم 3 أكتوبر 2016

الكونغو - مصر.. 3 أكتوبر 2016
مصر - غانا.. 7 نوفمبر 2016
أوغندا - مصر.. 28 أغسطس 2017
مصر - أوغندا.. 2 سبتمبر 2017
مصر - الكونغو.. 2 أكتوبر 2017
غانا - مصر.. 6 نوفمبر 2017

وجاءت مجموعات أفريقيا لتصفيات كأس العالم كاملة كالتالى:

المجموعة الأولى: تونس، ليبيا، الكونغو الديمقراطية، وغينيا.
المجموعة الثانية: الجزائر، زامبيا، نيجيريا، والكاميرون.
المجموعة الثالثة: الجابون، مالى، كوت ديفوار، والمغرب .
المجموعة الرابعة: السنغال، جنوب أفريقيا، بوركينا فاسو، وكاب فيردى.
المجموعة الخامسة: غانا، مصر، أوغندا، جمهورية الكونغو.