قدمت مصر اداء أكثر من رائع خلال تصفيات بطولة كأس أمم إفريقيا في أثيوبيا 1968, حيث تمكنت من تخطى منتخب ليبيا في الدور الأول بتعادل إيجابي خارج الديار 2-2 ثم الفوز في القاهرة بثلاثة اهداف مقابل هدفين في مباراة يشهد لها معاصروها بالإثارة والمتعة.

وفي الدور الثاني, لعبت مصر مجدداً المباراة الأولى خارج ملعبها أمام منتخب أوغندا, في الرابع من يونيو عام 1967, وحقق لاعبي الفراعنة فوزاً صعباً بهدف نظيف عن طريق المعلق الراحل محمود بكر, لاعب النادي الأوليمبي, لتقرر الإدارة المصرية عدم تنظيم لقاء العودة وتنسحب بشكل كامل من تصفيات البطولة.

استهل المنتخب المصري التصفيات المؤهلة إلى نهائيات كأس أمم إفريقيا 1982, بإقصاء المنتخب الكينيي, ليضرب الفراعنة موعداً نارياً مع المنتخب التونسي ولكن الأخير إنسحب لأسباب خاصة.

وتقدمت مصر بإعتذار رسمي عن المشاركة في البطولة وذلك على خلفية الخلافات المصرية العربية التي تبعت إجراء مصر لمعاهدة السلام بالإضافة إلى أسباب خاصة بتأمين البعثة المصرية داخل الأراضي الليبية.